Gene fragment | Primer name | Or.1 | Sequence (5′- 3′) | Reference | PCR conditions |
---|---|---|---|---|---|
12S | 12Sa | F | AAACTGGGATTAGATACCCCACTAT | Kocher et al. (1989) | 94º (5'); 94º (45"), 51º (45"), 72º (80") × 35; 72 (5') |
12Sb | R | GAGGGTGACGGGCGGTGTGT | Kocher et al. (1989) | ||
L1.STENO | F | GGATTAGATACCCCACTATGC | This study | 94º (5'); 94º (45"), 52º (45")’, 72º (90") × 35; 72º (5') | |
H1.STENO1 | R | TGACGGGCGGTGTGTACG | This study | Â | |
16S | 16Sa | F | CGCCTGTTTATCAAAAACAT | Palumbi (1996) | 94º (5'); 94º (45"), 51 (45"), 72 (80") × 35; 72º (5') |
16Sb | R | CCGGTCTGAACTCAGATCACGT | Palumbi (1996) | Â | |
16SaST | F | ATCAAAAACATCGCCTTTAGC | This study | 94º (5'); 94º (45"), 57º (45"), 72º (70") × 35; 72º (5') | |
16SbST | R | CTGAACTCAGATCACGTAGGAC | This study | Â | |
C- mos | FUF | F | TTTGGTTCKGTCTACAAGGCTAC | Gamble et al. (2008) | 94º (5'); 94º (30"), 55º (45"), 72º (70") × 35; 72º (10') |
FUR | R | AGGGAACATCCAAAGTCTCCAAT | Gamble et al. (2008) | Â | |
G73_STENO | F | GCTGTAAAGCAGGTGAAGAAATGC | This study | 94º (5'); 94º (45"), 56º (45"), 72º (80") × 35; 72º (5') | |
G74_STENO | R | GAACATCCAAAGTCTCCAATCTTGC | This study | Â | |
G73.5_STENO | F | GCATTTGGACTTAAAACCTG | This study | Â | |
G708 | R | GCTACATCAGCTCTCCARCA | Hugall et al. (2008) | Â | |
RAG -2 | RAG2-PY1-F | F | CCCTGAGTTTGGATGCTGTACTT | Gamble et al. (2008) | 94º (5'); 94º (45"), 55º (45"), 72º (70") × 35; 72º (5') |
RAG2-PY1-R | R | AACTGCCTRTTGTCCCCTGGTAT | Gamble et al. (2008) |