Hypothesis | Test MA/MAnull | Likelihood values | χ2 value | df | LRT p-value | |
---|---|---|---|---|---|---|
Clade 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
Clade Cα | MA | 7035.70 | 27.77 | 1 | 1.36E-07 | <0.001 |
 | MAnull | 7049.58 |  |  |  |  |
Branch Cα | MA | 7058.20 | 0 | 1 | 1 | NS |
 | MAnull | 7058.20 |  |  |  |  |
Branch I | MA | 7058.08 | 0 | 1 | 1 | NS |
 | MAnull | 7058.08 |  |  |  |  |
Clade Z | MA | 7050.24 | 5.25 | 1 | 0.022 | <0.05 |
 | MAnull | 7052.87 |  |  |  |  |
Branch IZ | MA | 7055.64 | 3.58 | 1 | 0.049 | <0.05 |
 | MAnull | 7057.58 |  |  |  |  |
Clade 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
Clade ε | MA | 2591.88 | 0 | 1 | 1 | NS |
 | MAnull | 2593.91 |  |  |  |  |
Branch ε | MA | 2601.60 | 0 | 1 | 1 | NS |
 | MAnull | 2601.60 |  |  |  |  |
Clade RΔ | MA | 2026.57 | 7.45 | 1 | 0.006 | <0.01 |
 | MAnull | 2030.29 |  |  |  |  |
Branch RΔ | MA | 2601.78 | 0.03 | 1 | 0.86 | NS |
 | MAnull | 2601.80 |  |  |  |  |
Clade 3 | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
Clade S | MA | 5205.54 | 3.15 | 1 | 0.076 | NS |
 | MAnull | 5207.11 |  |  |  |  |
Branch H | MA | 5211.87 | 0.05 | 1 | 0.816 | NS |
 | MAnull | 5211.90 |  |  |  |  |
Branch HS | MA | 5211.93 | 0 | 1 | 1 | NS |
 | MAnull | 5211.93 |  |  |  |  |
Branch M | MA | 5211.93 | 0 | 1 | 1 | NS |
 | MAnull | 5211.93 |  |  |  |  |
Clade EX | MA | 5193.81 | 13.47 | 1 | 2.42E-04 | <0.001 |
 | MAnull | 5200.55 |  |  |  |  |
Clade 4 | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
Branch Q | MA | 6960.59 | 0 | 1 | 1 | NS |
 | MAnull | 6960.59 |  |  |  |  |
Branch K | MA | 6956.33 | 0 | 1 | 1 | NS |
 | MAnull | 6956.33 |  |  |  |  |
Branch P | MA | 6958.79 | 5.14 | 1 | 0.023 | <0.05 |
 | MAnull | 6961.36 |  |  |  |  |
Clade Y | MA | 6960.24 | 2.75 | 1 | 0.097 | NS |
 | MAnull | 6961.61 |  |  |  |  |