Skip to main content

Table 1 Accession numbers for the genes used in the phylogenetic analysis.

From: The genomic environment around the Aromatase gene: evolutionary insights

Gene family

Gene

Accession number

Species

AP4E1

 

NP_031373

H. sapiens

  

ENSMUSP00000002063

Mus musculus

  

ENSGALP00000007610

Gallus gallus

  

SINFRUP00000132389

Fugu rubripes

  

GSTENG00025592001

T. nigroviridis

  

ENSXETP00000044864

X. tropicalis

  

ci0100133154 (scaffold11)

C. intestinalis

SSC-S2

 

ENSANGP00000018260

A. gambiae

 

CG4091

AAF47048

D. melanogaster

  

ci0100140958 (scaffold 92)

C. intestinalis

 

A

NP_055165

H. sapiens

  

ENSMUSP00000034810

M. musculus

  

ENSGALP00000007631

G. gallus

  

ENSXETP00000044865

X. tropicalis

 

B

NP_078851

H. sapiens

  

NP_081482

M. musculus

  

ENSXETP00000017843

X. tropicalis

  

SINFRUP00000149825

F. rubripes

  

GSTENT00011674001

T. nigroviridis

 

C

NP_997264

H. sapiens

  

ENSMUSP00000034810

M. musculus

  

ENSGALP00000007631

G. gallus

  

ENSXETP00000044865

X. tropicalis

  

SINFRUT00000165316 annotated as pseudogene

F. rubripes

  

GSTENT00018057001

T. nigroviridis

 

D

NP_689575

H. sapiens

  

ENSMUSP00000076961

M. musculus

  

ENSGALP00000006772

G. gallus

  

SINFRUP00000156999

F. rubripes

  

GSTENT00028868001

T. nigroviridis

Colmedin

CG6867

NP_573262

D. melanogaster

 

COF-2

AY494975

C. elegans

 

unc-122

AY494976

C. elegans

 

COL1

NP_861454

H. sapiens

  

NP_796324

M. musculus

  

ENSGALP00000021668

G. gallus

  

ENSXETP00000044876

X. tropicalis

 

COL1a

SINFRUP00000165325

F. rubripes

  

GSTENG00018059001

T. nigroviridis

 

COL1b

SINFRUP00000132381

F. rubripes

  

GSTENT00025590001

T. nigroviridis

DMXL

 

XP_314464.1

A. gambiae

 

DmX

NP_572302

D. melanogaster

  

CAB01916

C. elegans

  

ci0100136505 (scaffold149)

C. intestinalis

 

DMXL2

ENSGALP00000007662

G. gallus

  

NP_056078.1

H. sapiens

  

XP_358382.2

M. musculus

  

GSTENG00018060001

T. nigroviridis

  

SINFRUP00000166673

F. rubripes

  

ENSXETP00000044880

X. tropicalis

 

DMXL1

ENSGALP00000003481

G. gallus

  

CAA06718

H. sapiens

  

ENSMUSP00000045559

M. musculus

  

GSTENG00030946001

T. nigroviridis

  

SINFRUP00000162769

F. rubripes

  

ENSXETP00000038136

X. tropicalis

PPBP

PPBP1

NP_699205

H. sapiens

  

GSTENG00018055001

T. nigroviridis

  

SINFRUP00000165314

F. rubripes

  

ENSGALP00000007561

G. gallus

  

NP_081585

M. musculus

 

PPBP2

CAI16380

H. sapiens

  

ENSMUSP00000067811

M. musculus

  

ENSXETP00000017826

X. tropicalis

  

SINFRUP00000149824

F. rubripes

  

ENSXETP00000044860

X. tropicalis

  

ci0100137161 (scaffold34)

C. intestinalis

  

XP_321699

A. gambiae

  

NP_650352

D. melanogaster

TMOD

TMOD

AAL13319

C. elegans

 

TMOD ( spdo )

AAC04506

D. melanogaster

 

TMOD

ci0100140287 (scaffold487)

C. intestinalis

 

TMOD1

NP_003266

H. sapiens

  

NP_068683

M. musculus

  

NP_990105

G. gallus

  

ENSXETP00000022442

X. tropicalis

  

GSTENG00033528001

T. nigroviridis

  

SINFRUP00000157299

F. rubripes

 

TMOD2/3

GSTENG00018054001

T. nigroviridis

  

SINFRUP00000165312

F. rubripes

 

TMOD2

NP_055363

H. sapiens

  

Q9JKK7

M. musculus

  

ENSGALP00000007536

G. gallus

  

ENSXETP00000044853

X. tropicalis

 

TMOD3

NP_055362

H. sapiens

  

ENSMUSP00000072087

M. musculus

  

ENSGALP00000007492

G. gallus

  

ENSXETP00000044845

X. tropicalis

 

TMOD4

NP_037485

H. sapiens

  

NP_057921

M. musculus

  

NP_990105

G. gallus

  

SINFRUP00000149822

F. rubripes

  

GSTENG00011677001

T. nigroviridis

  

ENSXETP00000044853

X. tropicalis

CYP19

 

NP_112503

H. sapiens

   

B. floridae

  

AAF04617

D. sabina

  

AAK31803

Alligator mississippiensis

  

NP_001001761

G. gallus

  

P28649

M. musculus

  

ENSXETP00000044866

X. tropicalis

 

Cyp19a

GSTENP00025591001

T. nigroviridis

 

Cyp19b

GSTENP00018058001

T. nigroviridis

 

Cyp19a

NP_571229

D. rerio

 

Cyp19b

NP_571717

D. rerio

 

Cyp19a

SINFRUP00000132385

F. rubripes

 

Cyp19b

SINFRUP00000165318

F. rubripes

Others

AP3D

AAC14585

D. melanogaster

 

AP3D1

NP_003929

H. sapiens

 

OLFM2

ENSP00000264833

H. sapiens

 

CiOLF

ci0100131069(scaffold4)

C. intestinalis

 

Cyp4d2

Z23005

D. melanogaster

 

CYP4

ENSMUSP00000003574

M. musculus

 

CYP4

ci0100146084 (scaffold15)

C. intestinalis