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Table 1 The mitochondrial genome organization of Bursaphelenchus xylophilus (Bx) and Pratylenchus vulnus (Pv)

From: Comparative analysis of complete mitochondrial genome sequences confirms independent origins of plant-parasitic nematodes

Bursaphelenchus xylophilus

Pratylenchus vulnus

Gene

Positions and lengths of nucleotide sequences

No. of nt (bp)

Initiation and termination codons

Intergenic sequence

Gene

Positions and lengths of nucleotide sequences

No. of nt (bp)

Initiation and termination codons

Intergenic sequence

cox1

1-1563

1563

ATT/TAA

11

cox1

1-1533

1533

ATA/TAA

7*

trnC

1575-1628

54

 

5

NCR1

1534-8380

6847

  

trnM

1634-1687

54

 

20

trnH

8381-8434

54

  

trnD

1708-1762

55

 

3

NCR2

8435-9335

901

  

trnG

1766-1819

54

  

trnL1

9336-9393

58

 

2

cox2

1820-2509

690

ATT/TAG

−2

rrnL

9396-10290

895

 

21

trnH

2508-2562

55

  

nad3

10312-10641

330

ATT/TAG

9

rrnL

2563-3510

948

  

cob

10651-11757

1107

ATA/TAG

123

nad3

3511-3840

330

ATT/TAA

1

rrnS

11881-12566

686

  

nad5

3842-5410

1569

ATT/TAA

−1

trnY

12567-12620

54

  

trnA

5410-5464

55

  

trnW

12621-12676

56

  

trnP

5465-5521

57

  

nad1

12677-13549

873

TTG/TAA

1

trnV

5522-5578

57

  

trnL2

13551-13606

56

 

1

nad6

5579-6013

435

ATT/TAA

−1

nad2

13608-14429

822

ATA/TAG

 

nad4L

6013-6246

234

ATA/TAA

 

trnI

14430-14485

56

 

187

trnW

6247-6301

55

  

cox3

14673-15449

777

ATA/TAG

 

trnE

6302-6356

55

  

trnN

15450-15501

52

  

rrnS

6357-7056

700

  

trnG

15502-15557

56

 

1

trnS2

7057-7111

55

  

trnK

15559-15615

57

 

4

trnY

7112-7167

56

  

trnC

15620-15673

54

  

nad1

7168-8040

873

ATT/TAA

−5

trnF

15674-15728

55

  

atp6

8036-8630

595

ATT/T

 

nad6

15729-16157

429

TTG/TAG

326

trnK

8631-8690

60

  

nad4L

16484-16714

231

ATT/TAG

118

trnL2

8691-8745

55

  

cox2

16833-17513

681

ATA/TAG

67

trnS1

8746-8798

53

  

nad4

17581-18792

1212

ATA/TAA

9

nad2

8799-9623

825

ATT/TAA

11

trnD

18802-18857

56

  

trnI

9635-9694

60

 

5

trnM

18858-18911

54

 

42

trnR

9700-9752

53

 

5

trnT

18954-19007

54

 

45

trnQ

9758-9811

54

  

trnS1

19053-19111

59

 

11

trnF

9812-9865

54

  

atp6

19123-19704

582

ATT/TAG

75

cob

9866-10967

1102

ATA/T

 

nad5

19780-21240

1461

ATT/TAA

 

trnL1

10968-11022

55

  

trnS2

21241-21293

53

 

10

cox3

11023-11790

768

ATT/TAA

 

trnQ

21304-21358

55

 

2

trnN

11791-11844

54

  

trnA

21361-21416

56

 

7

trnT

11845-11898

54

  

trnP

21424-21476

53

  

nad4

11899-13128

1230

ATA/TAA

 

trnR

21477-21530

54

  

NCR

13129-14778

1650

  

trnV

21531-21586

56

 

1

     

trnE

21588-21645

58

  
  1. *7 bp intergenic sequence between trnE and cox1.